Os projetos de Manual de Boas Práticas de Fabricação são indispensáveis por representarem uma forma de regularizar seus produtos. Isso significa que quando uma empresa comercializa seus produtos sem um Manual de Boas Práticas, é possível que alguma multa seja aplicada ao estabelecimento. 

Além da preocupação financeira que um MBPF pode gerar,  ele é um documento completo com todas as medidas exigidas e que devem ser cumpridas pelo empreendimento para garantir a qualidade sanitária das mercadorias. Dessa forma, estabelecimentos que têm o MBPF passam mais segurança, não somente por evitar prejuízos à própria empresa, mas também por representarem uma forma de regularização técnica que pode gerar valor aos consumidores.